Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJE1A6NN92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJE1A6NN92 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJE1A6NN92 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJE1A6NN92 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJE1A6NN92 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJE1A6NN92 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJE1A6NN92 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJE1A6NN92 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJE1A6NN92 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJE1A6NN92 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms