Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT2A6NDA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT2A6NDA9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRIT2A6NDA9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIT2A6NDA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT2A6NDA9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms