Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM149AA5PLN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM149AA5PLN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM149AA5PLN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM149AA5PLN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM149AA5PLN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM149AA5PLN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms