Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RQS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms