Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0J9YYE9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0J9YYE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0J9YYE9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0J9YYE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0J9YYE9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0J9YYE9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0J9YYE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0J9YYE9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0J9YYE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms