Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMF1-BGLAPU3KQ54 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms