Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA4Q9Y5G9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGA4Q9Y5G9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGA4Q9Y5G9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA4Q9Y5G9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA4Q9Y5G9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA4Q9Y5G9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms