Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL3Q9Y4R7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL3Q9Y4R7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL3Q9Y4R7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL3Q9Y4R7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL3Q9Y4R7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms