Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R5

DOPEY2, Protein dopey-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOPEY2Q9Y3R5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DOPEY2Q9Y3R5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DOPEY2Q9Y3R5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOPEY2Q9Y3R5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOPEY2Q9Y3R5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DOPEY2Q9Y3R5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DOPEY2Q9Y3R5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms