Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RCE1Q9Y256 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCE1Q9Y256 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCE1Q9Y256 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCE1Q9Y256 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RCE1Q9Y256 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms