Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT11Q9UKZ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT11Q9UKZ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT11Q9UKZ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT11Q9UKZ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT11Q9UKZ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT11Q9UKZ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms