Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGFRNQ9P2B2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGFRNQ9P2B2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGFRNQ9P2B2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGFRNQ9P2B2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGFRNQ9P2B2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms