Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1GALT1Q9NS00 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C1GALT1Q9NS00 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1GALT1Q9NS00 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1GALT1Q9NS00 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms