Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX9Q9NQ69 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX9Q9NQ69 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX9Q9NQ69 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX9Q9NQ69 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX9Q9NQ69 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms