Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARS2Q9NP81 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARS2Q9NP81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARS2Q9NP81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms