Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRMDAQ9H2I8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRMDAQ9H2I8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRMDAQ9H2I8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMDAQ9H2I8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMDAQ9H2I8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms