Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ9H0N0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6CQ9H0N0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB6CQ9H0N0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ9H0N0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ9H0N0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6CQ9H0N0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms