Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRC27Q9C0I9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC27Q9C0I9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC27Q9C0I9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC27Q9C0I9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC27Q9C0I9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms