Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIP2Q9C0E4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIP2Q9C0E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIP2Q9C0E4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIP2Q9C0E4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIP2Q9C0E4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms