Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DPCDQ9BVM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DPCDQ9BVM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DPCDQ9BVM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DPCDQ9BVM2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DPCDQ9BVM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DPCDQ9BVM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DPCDQ9BVM2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DPCDQ9BVM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DPCDQ9BVM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms