Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRNP25Q9BV90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNRNP25Q9BV90 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNRNP25Q9BV90 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRNP25Q9BV90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNRNP25Q9BV90 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRNP25Q9BV90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms