Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC3Q9BQ90 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC3Q9BQ90 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC3Q9BQ90 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHDC3Q9BQ90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC3Q9BQ90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms