Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT43Q96FT9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT43Q96FT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT43Q96FT9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT43Q96FT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT43Q96FT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms