Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NMD3Q96D46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMD3Q96D46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NMD3Q96D46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NMD3Q96D46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NMD3Q96D46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMD3Q96D46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms