Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRAMD1AQ96CP6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1AQ96CP6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRAMD1AQ96CP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1AQ96CP6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRAMD1AQ96CP6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRAMD1AQ96CP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms