Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UPRTQ96BW1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPRTQ96BW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPRTQ96BW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPRTQ96BW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPRTQ96BW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms