Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRN2Q92932 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRN2Q92932 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRN2Q92932 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRN2Q92932 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms