Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RAD50Q92878 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RAD50Q92878 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAD50Q92878 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
RAD50Q92878 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RAD50Q92878 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RAD50Q92878 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAD50Q92878 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms