Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP205Q92621 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP205Q92621 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP205Q92621 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP205Q92621 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP205Q92621 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP205Q92621 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms