Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms