Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCG3Q8WXD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCG3Q8WXD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCG3Q8WXD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG3Q8WXD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCG3Q8WXD2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.7 ms