Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRHL3Q8TE85 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRHL3Q8TE85 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRHL3Q8TE85 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRHL3Q8TE85 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms