Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDND2Q8NHS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDND2Q8NHS1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDND2Q8NHS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND2Q8NHS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND2Q8NHS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms