Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BEST4Q8NFU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST4Q8NFU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST4Q8NFU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST4Q8NFU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms