Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE35

CPEB3, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB3Q8NE35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB3Q8NE35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB3Q8NE35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB3Q8NE35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB3Q8NE35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB3Q8NE35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPEB3Q8NE35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPEB3Q8NE35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEB3Q8NE35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEB3Q8NE35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms