Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF4

Putative uncharacterized protein FLJ33307, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NBF4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8NBF4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8NBF4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8NBF4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8NBF4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8NBF4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8NBF4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8NBF4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8NBF4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8NBF4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8NBF4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8NBF4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8NBF4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8NBF4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8NBF4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8NBF4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8NBF4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8NBF4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8NBF4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8NBF4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8NBF4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8NBF4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8NBF4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8NBF4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8NBF4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8NBF4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8NBF4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8NBF4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8NBF4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8NBF4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8NBF4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8NBF4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8NBF4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8NBF4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8NBF4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8NBF4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8NBF4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8NBF4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8NBF4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8NBF4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8NBF4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8NBF4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8NBF4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8NBF4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8NBF4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8NBF4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8NBF4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8NBF4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8NBF4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8NBF4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8NBF4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8NBF4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8NBF4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8NBF4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8NBF4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8NBF4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8NBF4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8NBF4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8NBF4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8NBF4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8NBF4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8NBF4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8NBF4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8NBF4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8NBF4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8NBF4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8NBF4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8NBF4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8NBF4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8NBF4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8NBF4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8NBF4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8NBF4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8NBF4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8NBF4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8NBF4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8NBF4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms