Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTD1Q8N815 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTD1Q8N815 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTD1Q8N815 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTD1Q8N815 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTD1Q8N815 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms