Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71E2Q8N5Q1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM71E2Q8N5Q1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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FAM71E2Q8N5Q1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM71E2Q8N5Q1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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