Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RPAP2Q8IXW5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RPAP2Q8IXW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RPAP2Q8IXW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RPAP2Q8IXW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RPAP2Q8IXW5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RPAP2Q8IXW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPAP2Q8IXW5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RPAP2Q8IXW5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RPAP2Q8IXW5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RPAP2Q8IXW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RPAP2Q8IXW5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms