Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PPARGC1BQ86YN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPARGC1BQ86YN6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
PPARGC1BQ86YN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PPARGC1BQ86YN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PPARGC1BQ86YN6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PPARGC1BQ86YN6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PPARGC1BQ86YN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PPARGC1BQ86YN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms