Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFX8Q6ZV50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFX8Q6ZV50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFX8Q6ZV50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX8Q6ZV50 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX8Q6ZV50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFX8Q6ZV50 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms