Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF05

TTC23L, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23LQ6PF05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC23LQ6PF05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC23LQ6PF05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC23LQ6PF05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC23LQ6PF05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC23LQ6PF05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms