Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WASHC2DQ5SRD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WASHC2DQ5SRD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WASHC2DQ5SRD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
WASHC2DQ5SRD0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WASHC2DQ5SRD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WASHC2DQ5SRD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms