Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHSL2Q5HYW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL2Q5HYW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHSL2Q5HYW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NHSL2Q5HYW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NHSL2Q5HYW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHSL2Q5HYW2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms