Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERC4Q5GLZ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC4Q5GLZ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERC4Q5GLZ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HERC4Q5GLZ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERC4Q5GLZ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms