Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFAF6Q330K2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFAF6Q330K2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFAF6Q330K2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAF6Q330K2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms