Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKPD1Q17RQ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKPD1Q17RQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKPD1Q17RQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKPD1Q17RQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKPD1Q17RQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms