Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCAQ16586 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCAQ16586 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCAQ16586 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCAQ16586 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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