Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3AQ14563 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3AQ14563 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3AQ14563 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA3AQ14563 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3AQ14563 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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