Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRIM29Q14134 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM29Q14134 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRIM29Q14134 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM29Q14134 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM29Q14134 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM29Q14134 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
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